Existuje niekoľko relevantných typov prechodného pobytu, o ktoré môže cudzinec zúčastňujúci sa rôznych foriem akademických a výskumných mobilít požiadať.

V závislosti od typu aktivity, ktorú na Slovensku plánuje vykonávať, a spôsobu jej realizácie možno požiadať o niektorý z nasledujúcich druhov prechodného pobytu:

• prechodný pobyt na účel štúdia v prípade študentov/doktorandov,
• prechodný pobyt na účel výskumu a vývoja v prípade výskumníkov s dohodou o hosťovaní,
• prechodný pobyt na účel osobitnej činnosti v prípade napr. v prípade lektorov - vysokoškolských učiteľov bez pracovnej zmluvy, účastníkov programov vlády SR, programov EÚ alebo programov vyplývajúcich z medzinárodných zmlúv, stážistov v rámci vysokoškolského štúdia mimo územia SR alebo do dvoch rokov po skončení štúdia,
• prechodný pobyt na účel zamestnania s pracovnou zmluvou,
• prechodný pobyt na účel vysokokvalifikovaného zamestnania (modrá karta EÚ).

Činnosť určujúcu účel prechodného pobytu vykonáva cudzinec z tretej krajiny na území Slovenskej republiky.

• Ak má cudzinec udelený prechodný pobyt v inom členskom štáte EÚ na účel štúdia na vysokej škole alebo výskumu a prichádza na Slovensko na študijnú/výskumnú mobilitu v trvaní do 360 dní (študenti), resp. 1 roka (výskumníci), vzťahujú sa naňho iné pravidlá.

Žiadosť sa predkladá osobne v zahraničí na slovenskom veľvyslanectve/ konzuláte teritoriálne kompetentnom pre domovskú krajinu cudzinca alebo na Slovensku na príslušnom oddelení cudzineckej polície. Na cudzineckej polícii môže byť žiadosť prijatá, len ak sa štátny príslušník tretej krajiny zdržiava na Slovensku, keďže:

• má platné povolenie na pobyt,
• má udelený tolerovaný pobyt,
• je držiteľom národného víza,
• ide o štátneho príslušníka tretej krajiny, u ktorého sa vízum nevyžaduje, alebo
• ide o držiteľa osvedčenia Slováka žijúceho v zahraničí.

Spravidla je nevyhnutné podať úplnú žiadosť so všetkými prílohami, inak nebude prijatá. Termín na podanie žiadosti o prechodný pobyt je potrebné si zarezervovať  prostredníctvom online Objednávacieho systému cudzineckej polície v dostatočnom časovom predstihu.

Ak zastupiteľský úrad alebo policajný útvar žiadosť neprijme, poskytne žiadateľovi písomnú informáciu o tom, ktoré doklady musí doložiť, aby sa jeho žiadosť prijala.

Ak sa žiadosti o udelenie prechodného pobytu vyhovie, policajný útvar zašle žiadateľovi písomné oznámenie, že mu bol pobyt udelený, v ktorom uvedie dátum udelenia a dátum skončenia platnosti jeho pobytu.

Pri rozhodovaní o čase, na ktorý má byť prechodný pobyt udelený, sa neprihliada na časovú platnosť cestovného dokladu, ale prihliada sa na ňu v prípade vydávania dokladu o pobyte (plastová kartička), ktorý je vydávaný na obdobie minimálne o 90 dní kratšie ako je platnosť cestovného dokladu.

Obnovenie a zmena účelu prechodného pobytu